Это позволит ускорить разработку лекарств и проверять гипотезы без использования модельных организмов и живых клеток.
Ученые Научно-технологического университета «Сириус» при поддержке Российского научного фонда (РНФ) моделируют виртуальную клетку, которая поможет воспроизводить экспериментальные данные для конкретных типов клеток человека. Это даст возможность существенно сэкономить время при поиске новых мишеней и лекарственных средств за счет проверки вариантов взаимодействия на молекулярном уровне.
Итогом исследования станет модель для проведения тестирования, которая позволит сравнивать показатели виртуальной клетки с реальными данными, полученными от живых образцов. Сегодня уже существуют модели клетки для простых организмов, об особенностях метаболизма которых получено достаточно данных, в то время как человеческий организм состоит из множества разных групп клеток, а их взаимодействие – предмет изучения по всему миру уже многие годы.
«Построение математической или компьютерной модели – это систематизация существующих знаний. Поэтому создание такой детальной виртуальной клетки позволит существенно расширить наше понимание работы организма», – отмечает Федор Колпаков, научный руководитель направления «Вычислительная биология» Научно-технологического университета «Сириус».
Важным компонентом при создании виртуальной клетки станет разработанная учеными платформа BioUML. Она служит инструментом для построения моделей сложных биологических систем. С ее помощью уже созданы модели процессов запрограммированной клеточной смерти и регуляции артериального давления.
Виртуальная клетка ученых Университета «Сириус» – это проект с открытым исходным кодом, то есть исследователи готовы к сотрудничеству для создания наиболее эффективной и точной модели.
В разработке примут участие аспиранты и магистранты программы «Биоинформатика». Проект реализуется в рамках государственной программы научно-технологического развития федеральной территории «Сириус» и регионального конкурса Российского научного фонда (проект № 24-14-20031) с 2024 по 2026 год.
Ученые Научно-технологического университета «Сириус» при поддержке Российского научного фонда (РНФ) моделируют виртуальную клетку, которая поможет воспроизводить экспериментальные данные для конкретных типов клеток человека. Это даст возможность существенно сэкономить время при поиске новых мишеней и лекарственных средств за счет проверки вариантов взаимодействия на молекулярном уровне.
Итогом исследования станет модель для проведения тестирования, которая позволит сравнивать показатели виртуальной клетки с реальными данными, полученными от живых образцов. Сегодня уже существуют модели клетки для простых организмов, об особенностях метаболизма которых получено достаточно данных, в то время как человеческий организм состоит из множества разных групп клеток, а их взаимодействие – предмет изучения по всему миру уже многие годы.
«Построение математической или компьютерной модели – это систематизация существующих знаний. Поэтому создание такой детальной виртуальной клетки позволит существенно расширить наше понимание работы организма», – отмечает Федор Колпаков, научный руководитель направления «Вычислительная биология» Научно-технологического университета «Сириус».
Важным компонентом при создании виртуальной клетки станет разработанная учеными платформа BioUML. Она служит инструментом для построения моделей сложных биологических систем. С ее помощью уже созданы модели процессов запрограммированной клеточной смерти и регуляции артериального давления.
Виртуальная клетка ученых Университета «Сириус» – это проект с открытым исходным кодом, то есть исследователи готовы к сотрудничеству для создания наиболее эффективной и точной модели.
В разработке примут участие аспиранты и магистранты программы «Биоинформатика». Проект реализуется в рамках государственной программы научно-технологического развития федеральной территории «Сириус» и регионального конкурса Российского научного фонда (проект № 24-14-20031) с 2024 по 2026 год.
